Автономная некоммерческая организация «Московская дирекция транспортного обслуживания» учреждена в соответствии с распоряжением Мэра Москвы С.С. Собянина от 14 августа 2019 года № 434-РП для совершенствования транспортного обслуживания населения и организаций, осуществляющих проведение развлекательных, культурных, спортивных мероприятий, а также обеспечения транспортом объектов массового посещения в городе Москве.
Правительство Москвы в лице Департамента транспорта и развития дорожно-транспортной инфраструктуры города Москвы осуществляет от имени города Москвы полномочия единственного учредителя автономной некоммерческой организации «Московская дирекция транспортного обслуживания».